产品货号:
BTN71205
中文名称:
土壤DNA提取试剂盒
英文名称:
Soil DNA column extraction kit
产品规格:
50T
发货周期:
1~3天
产品价格:
询价
本制品是专门用于从各种土壤样品和河海沉积物中提取高质量的DNA的试剂盒。
保存:室温,有效期1年。
氯仿
相关搜索:土壤DNA提取试剂盒,土壤DNA提取,Soil DNA column extraction kit
- 去污染效果好,得到的DNA可以直接作为PCR模板或酶切,不需要再进行去腐殖酸处理。
- 操作过程简单快速,整个操作只需要10多分钟,扩容性好。
- 产量高,每克土壤一般可以提取到5~50μg DNA,片段长度在20~50kb,OD260/280一般都在1.8以上。
- 适合于各种土壤(包括河海沉积物)。
组分 | 规格 |
土壤DNA纯化溶液A | 25mL |
土壤DNA纯化溶液B | 25mL |
专用上柱液 | 40mL |
离心吸附柱 | 50套 |
通用洗柱液 | 50mL |
DNA洗脱液 | 10mL |
保存:室温,有效期1年。
氯仿
- 65℃预热土壤DNA纯化溶液A,待其沉淀溶化后充分颠倒混匀。取0.5mL加入到1.5mL塑料离心管中并放置于65℃待用。
- 称取0.1~0.3g的土壤,加入到装有预热的土壤DNA纯化溶液A的离心管中。
- 震荡器上剧烈震荡5~10分钟。如果是扩量操作,可以使用更多土壤和较大离心管。也可以将同一种土壤在较大离心管中震荡处理,然后再分到1.5mL离心管中。
- 不论使用大的还是小的离心管,一定要让管底的土壤震荡起来。
- 将离心管置于65℃水浴中保温至少5分钟。
- 14000g室温离心3分钟,将上清转移到一新离心管中(上清液一般呈淡黄色或深棕色,实际颜色取决于腐殖酸的含量,上清液的体积一般为300~400μL)。
- 在上清液中加入等体积的土壤DNA纯化溶液B,上下颠倒30秒充分混匀,溶液将呈白色或淡黄色混浊状。
- 将离心管冰浴至少5分钟。
- 14000g室温离心3分钟,转移上清到新的1.5mL离心管,上清液颜色将比第4步得到的上清的颜色稍淡,体积约0.7mL。
- 下面第8-第9步的氯仿抽提操作可以省略,直接进入第10步,但DNA的产量会低50%左右,OD260/280在1.7-1.8。如果省略第8~9步直接进入第10步,则转移的溶液体积不要超过0.6mL,否则没有空间加专用上柱液。
- 加入0.2mL的氯仿(自备),震荡器上充分振荡30秒混匀。
- 一定要让管底的溶液震荡起来。
- 14000g室温离心3分钟,小心转移上清到新离心管中。
- 离心后两相交界面有白色膜状物,有机相部分颜色较深,一般呈淡棕色。上清的颜色取决于土壤中腐殖酸的含量。
- 将上清转移到新的1.5mL离心管时,不要超过0.6mL,否则没有空间加专用上柱液。如果有多余的可以弃之不用。
- 离心后两相交界面有白色膜状物,有机相部分颜色较深,一般呈淡棕色。上清的颜色取决于土壤中腐殖酸的含量。
- 加入1.5倍体积的专用上柱液,上下颠倒30秒混匀。
- 分两次上柱(即先转移一半的混合液到离心吸附柱中,14000g室温离心半分钟,弃穿透液,然后再将剩下的混合液到离心吸附柱中,14000g室温离心半分钟,弃穿透液)。
- 加0.7mL通用洗柱液到离心吸附柱中,14000g室温离心半分钟,弃穿透液。
- 再加0.3mL通用洗柱液到离心吸附柱中,14000g室温离心半分钟,弃穿透液。
- 增加一步洗涤能使最后得到的DNA的纯度稍有提高。
- 14000g室温再离心半分钟。此步十分重要,否则残留的通用洗柱液会污染DNA。
- 将离心吸附柱转移到一新的1.5mL塑料离心管中,加入50μL DNA洗脱液。
- 室温放置离心吸附柱1~2分钟。
- 14000g室温离心半分钟,离心管中溶液即为提取到的DNA样品,可以立即使用或存放于冰箱待用。
- 如何判断提取的DNA没有腐植酸污染?
一是目测法,即看得到的溶液是否无色。如果呈淡棕黑色或淡黄色,说明可能是少量残留的未除尽的腐植酸。二是检测最大光吸收。- 有腐植酸污染并不表示DNA不能使用,有的腐殖酸并不抑制PCR扩增。
- 腐殖酸的最大吸收波长是多少?
腐植酸(humic acid)是一大类呈棕黑色或黑色的物质,其结构千差万别,土壤中腐殖酸的组成和特点随土壤不同而不同,所以其最大吸收波长也各不相同,有的土壤的腐殖酸在260nm有最大吸收,有的则在340nm。所以用特定的波长测定OD值时波长的选定要根据土壤而决定。Sigma,Fluke等公司出售的腐植酸产品成分一般比较简单,其最大吸收波长不能推广到成分更为复杂的土壤腐殖酸样品。 - 是否腐植酸都会抑制后续的DNA反应?
否,因为腐植酸是一大类物质的统称,他们的结构和特性各不相同,所以是否对后续反应有影响最好通过实验来验证。如果用提取的DNA溶液原液进行反应而反应没发生,而对照样品(已知的不含污染的DNA)能够发生,说明可能抑制作用。 - 如果得到的DNA样品还是含有抑制后续反应的腐植酸,如何去除?
如果提取的DNA原液不能扩增,可以将样品稀释10倍和100倍再进行PCR,抑制作用一般可以解除。如果仍然抑制,可以使用本公司的PCR抑制物清除剂。如果仍然不能解除,则可以通过腐殖酸清除剂(过柱法)去除。
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